ATRIO D'INGRESSO A SINISTRA
Nella zona d'ingresso verso il Piccolo Cottolengo e viale Caterina da Forlì, dietro alla cancellata dove sorgeva il battistero, è stata posta la statua di san Pio X benedicente, vestito di bianco, con le babbucce rosse.
1° CAPPELLA SINISTRA: ALTARE DI SAN GIUSEPPE
La cappella, benedetta nel 1958, è ornata da una statua lignea di San Giuseppe, opera dello scultore J. Stuflesser della Val Gardena, donata da una benefattrice già nel 1956. San Giuseppe tiene in braccio Gesù Bambino benedicente, mentre con la mano sinistra regge la verga fiorita con la colomba dello Spirito Santo (iconografia tradizionale derivante dai Vangeli apocrifi, in cui si narra che il santo ottenne in sposa la Madonna perché, dopo un voto fatto insieme ad altri pretendenti, solo a lui fiorì per miracolo il ramoscello assegnatogli). L'altare marmoreo fu progettato dall'architetto Baciocchi e sul profilo della mensa si legge “JOSEPH OPIFEX SANCTE, OPERA NOSTRA TUERE”. Gli allievi della Scuola d’arte sacra “Beato Angelico” di Milano realizzarono lo sportello in bronzo del tabernacolo, con il Golgota su cui è posto l'Agnus Dei con nimbo crocifero, trafitto dalla croce con vessillo: dalla ferita si genera una sorgente sacra da cui nascono gigli (“IN SANGUINE AGNI LILIA CRESCENT”). Le vetrate policrome con le storie del santo, realizzate dall'artista Ettore Paganini, furono messe in opera nel 1961. A sinistra dall'alto: Sposalizio di Giuseppe e Maria, Natività, Presentazione al tempio, Adorazione dei Magi, Sogno di Giuseppe relativo alla strage degli innocenti; a destra, dall'alto: Fuga in Egitto, Gesù ritrovato tra i dottori del tempio, Gesù aiuta san Giuseppe falegname, Morte di Giuseppe, Gloria di Giuseppe e angeli reggenti la Basilica di San Pietro, simbolo della Chiesa.
2° CAPPELLA SINISTRA: ALTARE DELLA MADONNA
La cappella, progettata dall'architetto Baciocchi e inaugurata l’1 maggio 1957, ha un altare in marmo botticino classico, la cui semplice mensa è retta da due colonnine con capitelli crociati, intrecci e volute, che ricordano quelli longobardi, mentre il pavimento è in marmo mazzano, le colonne e la parete di fondo in marmo rosa del Garda. La statua lignea del XVII secolo, dono del 1952 di Caterina Volpato, finanziatrice di tutta la cappella, rappresenta la Madonna con Bambino: entrambi hanno gli occhi azzurri, il Bambino regge uno scettro e benedice, mentre Maria, vestita con manto dorato, indica il Figlio e tiene un rosario. Lo sportello bronzeo del tabernacolo, con la Madonna e il Bambino, fu realizzato dal celebre scultore Arnaldo Pomodoro: la Vergine seduta ha una figura allungata, dai volumi arcaici; il Bambino è rivolto verso la Madre come un neonato in cerca del latte. Le vetrate policrome rappresentano a sinistra angeli adoranti reggenti gigli, una lucerna, un cartiglio con “AVE MARIA”, un libro di preghiere, mentre alla base si legge: “ET INGRESSUS ANGELUS AD EAM, DIXIT: AVE GRATIA PLENA DOMINUS TECUM”. La vetrata destra invece è legata ai dolori della Vergine e gli angeli reggono i simboli della Passione: calice, fazzoletto della Veronica, chiodi, martello, drappo rosso, lancia e spugna, flagello, corona di spine, cartello INRI, mentre alla base si legge: “APPARUIT AUTEM ILLI ANGELUS DE CAELO, CONFORTANS EUM”.
1° CAPPELLA DESTRA: ALTARE DI SANT'ANTONIO
Nello spazio corrispondente all'atrio di sinistra si trova l'altare dedicato a Sant'Antonio da Padova, caratterizzato da una statua lignea del santo con in braccio il Bambino benedicente e una pagnotta nella mano destra.
2° CAPPELLA DESTRA: ALTARE DI SAN LUIGI ORIONE
Benedetto nel 1961 come altare dedicato a san Giuseppe Benedetto Cottolengo, è stato in seguito dedicato a san Luigi Orione. Sopra l'altare vi è un dipinto che raffigura san Luigi Orione in abiti sacerdotali, raggiante di luce e circondato dai fedeli, in primo piano i bambini poveri e gli orfanelli, mentre sullo sfondo si staglia la sagoma del Santuario della Madonna della Guardia di Tortona. Le vetrate laterali , opera dell’artista Valerio Giuseppe Egger, raffigurano episodi della vita di don Orione, con brevi didascalie. A sinistra, dal basso, La rosa che non appassisce indica la nascita di Luigi Orione, Il miracolo del fiore sonante, Luigi Orione si offre questuante con i francescani, Luigi Orione sogna don Bosco che gli offre la veste sacerdotale, Luigi Orione viene ordinato sacerdote. A destra, dall'alto: Luigi Orione davanti al papa Pio X, Luigi Orione istituisce la Congregazione delle “Piccole Suore della Carità”, Luigi Orione soccorre gli orfani di Messina e Marsica, Luigi Orione visita il Piccolo Cottolengo di Milano, Morte santa invocando Gesù.
3° CAPPELLA DESTRA: ALTARE DEL SACRO CUORE
L'altare, benedetto nel 1961, è costituito da due ordini di colonnine, mentre al di sopra della mensa si alternano nicchie rettangolari e semicircolari dorate, con al centro il tabernacolo con croce gemmata. Al di sopra, è stato posto il mosaico raffigurante Gesù Cristo Risorto, anch'esso ideato da Valerio Pilon e realizzato da Paolo Maimonte (1994). Cristo vestito di bianco e con drappo rosso su sfondo azzurro e illuminato dall'alto da un raggio in cui si colloca la Trinità. Tiene in mano uno scettro sormontato dal suo Sacro Cuore sfavillante. Al di sotto si apre la veduta delle due ali del Piccolo Cottolengo con al centro la chiesa di San Benedetto. Le vetrate policrome risalgono al 1983, opera di Giacomo Marra. Quelle di sinistra mostrano in alto Gesù Buon Pastore con in braccio la pecorella smarrita, in basso la Resurrezione di Lazzaro; quelle di destra, in alto, Cristo benedice il pane e, sotto, la Parabola del Figliol prodigo.